Cnr. Ricostruito il genoma mitocondriale a partire da piccoli frammenti

Merito delle ultimissime tecniche di bioinformatica sviluppate dall'Istituto di biomembrane e bioenergetica. Con il nuovo metodo sarà possibile studiare il genoma mitocondriale e il suo coinvolgimento in centinaia di malattie di cui non si conoscono i geni responsabili.

27 GIU - La caccia alle mutazioni genetiche oggi si fa con l’aiuto dell’informatica: partendo da frammenti di sequenze genomiche prodotte per tutt'altro scopo, è possibile recuperare le informazioni necessarie a ricostruire in maniera pressoché completa il genoma mitocondriale, ovvero il Dna di quegli organelli che rappresentano la 'centrale energetica' delle cellule e che hanno un patrimonio genetico indipendente da quello nucleare racchiuso nei cromosomi.  Questa l'innovativa metodica bioinformatica che è valsa la pubblicazione su Nature Methods ad un team di ricerca italiano dell'Istituto di biomembrane e bioenergetica del Consiglio nazionale delle ricerche (Ibbe-Cnr) e del dipartimento di Bioscienze, biotecnologie e scienze farmacologiche dell'Università di Bari.
 
“È stata la 'caccia' alle mutazioni finalizzata alla ricerca di possibili terapie a portare all'elaborazione di protocolli sperimentali che non contemplano tutte le informazioni disponibili e necessarie, come quelle riguardanti il Dna mitocondriale e il suo contributo nella patogenesi di molte malattie genetiche", ha spiegato Graziano Pesole, direttore dell’Ibbe-Cnr, che ha condotto questo studio insieme a Ernesto Picardi, ricercatore dello stesso istituto. Fino ad oggi infatti il genoma mitocondriale era rimasto quasi ignorato dai ricercatori che si sono dedicati al sequenziamento dell'esoma, ovvero delle regioni di Dna codificanti per proteine, allo scopo di trovare mutazioni associate a malattie.  "Quello dei mitocondri costituisce circa il 2% del Dna cellulare e assolve funzioni di importanza vitale", ha proseguito. "Mutazioni del genoma mitocondriale sono responsabili di malattie gravissime che compromettono la funzionalità del sistema muscolare e nervoso o che sono associate a processi di invecchiamento e tumorigenesi. Le malattie cosiddette mitocondriali, come la sindrome di Leigh, di Kearns-Sayre, di Pearson o diverse encefalopatie e neuropatie, hanno un'incidenza media di 1/4000, colpiscono soprattutto bambini e si distinguono per il fatto che, come il Dna mitocondriale, sono ereditate esclusivamente per via materna".

Ma l'avvento delle piattaforme di sequenziamento di nuova generazione, pur determinando una trasformazione epocale nella ricerca biomolecolare, richiede l'elaborazione di strategie che consentano l'interpretazione biologica dell'enorme mole di dati prodotti. In questo ambito, la metodologia messa a punto dai ricercatori del Cnr e di Uniba, che consente di ricostruire l'intero Dna mitocondriale utilizzando l'enorme mole di dati di sequenziamento massivo già esistenti per moltissime patologie, apre un nuovo orizzonte per la ricerca sulle malattie genetiche. "Sarà possibile, infatti studiare il coinvolgimento del genoma mitocondriale in centinaia di malattie di cui non si conoscono il gene o i geni responsabili”, ha concluso Pesole. “Questo porrà le basi per la predisposizione di nuovi protocolli, sia diagnostici che prognostici, e per l'applicazione di nuove strategie terapeutiche".

27 giugno 2012
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